দলের বর্তমান আমির ডা. শফিকুর রহমান ১৯৯৮ সালে কেন্দ্রীয় কর্মপরিষদ সদস্য হিসেবে দায়িত্ব পালন শুরু করেন।
এরপর সিলেট মহানগর আমির, কেন্দ্রীয় সহকারী সেক্রেটারি জেনারেল, নির্বাহী পরিষদ সদস্য, ভারপ্রাপ্ত সেক্রেটারি জেনারেল এবং পরে সেক্রেটারি জেনারেল হিসেবে দায়িত্ব পালন করেন।
ডা. শফিকুর রহমানের আগে দলের আমির ছিলেন মকবুল আহমদ (২০১৮-২০২০)। তিনি ২০২১ সালের ১৩ এপ্রিল বার্ধক্যজনিত কারণে মারা যান।
তাঁর আগে আমির ছিলেন মাওলানা মতিউর রহমান নিজামী, যিনি ২০০০ থেকে ২০১৬ সাল পর্যন্ত আমিরের দায়িত্ব পালন করেন।
উল্লেখ্য, জামায়াতের আমির দলের রুকনদের গোপন ভোটে নির্বাচিত হলেও সেক্রেটারি নির্বাচিত হন আমিরের পছন্দে।
অর্থাৎ দলের আমির নিজের পছন্দমতো কাউকে সেক্রেটারি মনোনীত করে থাকেন।
